Промышленные отходы и интенсивное использование удобрений и пестицидов в сельском хозяйстве способствовали серьезному загрязнению рек и озер Узбекистана. Загрязненная питьевая вода считается причиной многих нарушений здоровья человека. Сельскохозяйственные химикаты, включая ДДТ, также загрязнили почву в районах выращивания сельскохозяйственных культур. В 1992 году правительство учредило Государственный комитет по охране окружающей среды. Тем не менее, неправительственные организации (НПО) стали лидерами в реализации экологических инициатив, особенно в том, что касается сохранения и защиты региональных водных ресурсов. Широкомасштабное использование химикатов для выращивания хлопка, неэффективные ирригационные системы и плохие дренажные системы являются примерами условий, которые привели к высокой фильтрации засоленной и загрязненной воды обратно в почву. Постсоветская политика стала еще более опасной, в начале 1990-х годов среднее применение химических удобрений и инсектицидов в республиках Центральной Азии составляло от двадцати до двадцати пяти килограммов на гектар по сравнению с прежним средним показателем в три килограмма на гектар для всего Советского Союза. В результате запас пресной воды получил дополнительные загрязнения. Промышленные загрязнители также повредили воду в Узбекистане. В Амударье концентрации фенола и нефтепродуктов были измерены намного выше приемлемых санитарных норм. В 1989 году министр здравоохранения Туркменской ССР охарактеризовал Амударью как канализацию для промышленных и сельскохозяйственных отходов. Эксперты, которые проводили мониторинг реки в 1995 году, сообщили о еще большем ухудшении состояния. В начале 1990-х годов около 60 процентов средств, предназначенных для борьбы с загрязнением, направлялось на проекты, связанные с водой, но только около половины городов и около четверти деревень имеют канализацию. Системы коммунального водоснабжения не соответствуют санитарным нормам, большая часть населения не имеет систем питьевого водоснабжения и должна пить воду прямо из загрязненных ирригационных каналов, каналов или самой Амударьи. Согласно одному отчету, практически все крупные подземные источники пресной воды в Узбекистане загрязнены промышленными и химическими отходами. По оценкам чиновника Министерства окружающей среды Узбекистана, около половины населения страны проживает в регионах, где вода сильно загрязнена. По оценкам правительства, в 1995 году только 230 из 8000 промышленных предприятий страны соблюдали стандарты контроля загрязнения. Качество питьевой воды является серьезной проблемой, особенно в западной провинции Каракалпакстан, где вода не распределена должным образом, а источники подвержены различным типам поверхностного и подземного загрязнения. Неадекватная очистка сточных вод усугубляет проблему загрязнения воды в Узбекистане: только 40 процентов населения обслуживается системами канализации. Около 15 000 гектаров пастбищ ежегодно теряются из-за соли и пыли. Загрязнение почвы является самым высоким в сельскохозяйственных районах, которые подвергались ежегодным передозировкам удобрений и пестицидов. Неконтролируемая рубка леса поставила под угрозу несколько оставшихся лесных насаждений. Дефолиаты, пестициды и удобрения хлопкового производства попали в реки, ручьи, озера и грунтовые воды. Промышленное загрязнение и отходы горнодобывающей промышленности также нашли свое применение в водоснабжении. Река Аму является важным источником питьевой воды, хотя она загрязнена неочищенными сточными водами, пестицидами и удобрениями. Пестициды и удобрения (ДДТ и бутфос ) загрязнили питьевую воду. Следы были обнаружены в молоке кормящих матерей. Люди, которые потребляли воду из Аму и Сыра, имели высокий уровень заболеваемости гепатитом, тифом, туберкулезом и другими заболеваниями. «Невозможно было смешать детскую смесь, – сказал один врач, – он превращался в липкую жидкость, как мягкий сыр». Загрязнение воздуха Плохое управление водными ресурсами и интенсивное использование сельскохозяйственных химикатов также загрязняют воздух. Соли и пыльные бури, а также разбрызгивание пестицидов и дефолиантов для урожая хлопка привели к серьезному ухудшению качества воздуха в сельских районах. В городских районах заводы и автомобильные выбросы представляют собой растущую угрозу качеству воздуха. Менее половины заводских дымовых труб в Узбекистане оснащены фильтрующими устройствами, и ни одна из них не способна фильтровать газообразные выбросы. Кроме того, большой процент существующих фильтров неисправен или не работает. Данные о загрязнении воздуха для Ташкента, Ферганы и Олмалыка показывают, что все три города превышают рекомендуемые уровни содержания двуокиси азота и твердых частиц. Высокие уровни содержания тяжелых металлов, таких как свинец, никель, цинк, медь, ртуть и марганец, были обнаружены в атмосфере Узбекистана, главным образом в результате сжигания ископаемого топлива, отходов, а также черной и цветной металлургии. Особенно высокие концентрации тяжелых металлов были зарегистрированы в Тошкентской области и в южной части Узбекистана вблизи Олмалыкского металлургического комбината. В середине 1990-х годов промышленное производство в Узбекистане, около 60 процентов от общего объема для стран Центральной Азии, за исключением Казахстана, также принесло около 60 процентов от общего объема выбросов вредных веществ в атмосферу в Центральной Азии. Поскольку автомобилей относительно мало, автомобильный выхлоп является проблемой только в Ташкенте и Фергане. Глобальное потепление, саранча и разливы нефти Согласно одному исследованию, страны Центральной Азии и к югу от Сахары, как ожидается, больше всего пострадают от глобального потепления. Температура в этих местах может подняться на 5 градусов Цельсия. Региональные эксперты утверждают, что солевые и пыльные бури из Аральского моря подняли уровень твердых частиц в земной атмосфере более чем на 5 процентов, что серьезно сказалось на глобальном изменении климата. Разлив нефти в Ферганской долине, также известный как разлив Мингбулакойл, был худшим разливом нефти на суше в истории Азии. Разлив нефти был вызван выбросом 2 марта 1992 г. на нефтяном месторождении Мингбулак в Ферганской долине, Узбекистан, на скважине № 5. Сырая нефть, выпущенная из скважины, горела в течение двух месяцев. В результате выброса было выпущено 35 000 баррелей (5600 кубометров) до 150000 баррелей (24000 кубометров) в день. В общей сложности за аварийными дамбами было собрано 2 000 000 баррелей (320 000 кубических метров). Масло перестало течь само собой. Всего было выпущено 285 000 тонн нефти, и это был пятый по величине разлив нефти в истории. Разлив считается крупнейшим внутренним разливом в истории. Центральная Азия страдает от саранчовых эпидемий. Огромная чума уничтожила 330 000 гектаров в Узбекистане в 1999 году. Столь же разрушительные рои произошли в Казахстане.